Miejscowość Stare Bogaczowice, wcześniej Bogaczowice pojawia się w dokumentach po raz pierwszy w 1228 roku w księdze założycielskiej klasztoru w Henrykowie, gdy stała się z przekazu księcia Henryka I Brodatego własnością przybyłych z Lubiąża cystersów. Najstarsze informacje o Starych Bogaczowicach łączą się z osobą kanonika i notariusza księcia Henryka I — Mikołaja, który pochodził z okolic Krakowa, a z nadania księcia miałby już w 1222 roku posiadać 100 łanów w lesie, który to majątek został nazwany Richnov. Te sto łanów zostało przekazanych przez zmarłego w 1227 roku Mikołaja, a oficjalnie zatwierdzonych na prośbę biskupa wrocławskiego Wawrzyńca i biskupa poznańskiego Pawła przez księcia, cystersom z Henrykowa 6 czerwca 1228 roku w dniu św. Wincentego. Wspomniane nadania potwierdzone są ponownie w dokumencie księcia Bolesława II z 1263 roku. W dokumencie henrykowskim wymieniony jest wójt Siegfried Rindfleisch, a w dokumencie z 1265 roku proboszcz Achilles. W końcu XIII wieku była to już osada znacząca, o czym świadczy istnienie warsztatów rzemieślniczych — wieś miała prawo do dwóch kuźni, mogli tu pracować szewc, piekarz i rybak.
Istniejący już wówczas parafialny kościół św. Mikołaja znajdował się na północnym brzegu rzeki —jest to prawdopodobnie najstarszy obszar wsi. Od 1292 roku miejscowość wraz z kościołem stała się własnością cystersów krzeszowskich, które to nadanie potwierdzone było w dokumentach księcia Bolka I również w latach 1293 i w 1299 — Bolko I pozostawił sobie jednak do wsi prawo książęce. Po 1300 roku posiadłości we wsiach były przez cystersów rozszerzane. W 1318 roku we wsi była karczma, wolny wyszynk i dom parafialny — wówczas proboszczem był pochodzący z Pomorza Liczko.
W 1427 roku Stare Bogaczowice podobnie jak klasztor w Krzeszowie prawdopodobnie zostały zniszczone przez Husytów.
Według dokumentów z archiwum parafialnego badacze podają datę 1518 odnoszącą się do budowy w dolnej części wsi nowego kościoła za opata Franza Buttnera. W pobliżu kościoła istniał cmentarz.
W 1547 roku opat krzeszowski Johann V zastawił Stare i Nowe Bogaczowice oraz Chwaliszów radcy cesarskiemu Hansowi von Schaffgotsch, który w 1573 roku przeszedł na luteranizm. Być może on ustanowił protestanckiego proboszcza w Starych Bogaczowicach. W 1571 roku opat Krzeszowa Christoph Scholtz odkupił te miejscowości od Hansa Schaffgotscha — miejscowość stała się ponownie własnością klasztorną. Proboszczowie ze Starych Bogaczowic zajmowali wysokie stanowiska w hierarchii konwentu cysterskiego. Po 1611 roku trzej kolejni proboszczowie bogaczowiccy zostawali opatami krzeszowskimi. Poprzez związek miejscowości z klasztorem mieszkańcy wsi wcześnie powrócili na katolicyzm. Wiadomo, że 24 lutego 1654 roku wieś była już wsią katolicką. Po zakończeniu wojny trzydziestoletniej opat Andreas Michaelis sprowadził katolików z Brandenburgii i Saksonii. Od 1653 roku katolickim proboszczem parafii w Bogaczowicach i w Gostkowie był cysters Martin Teichgraber. Jemu również zostały przekazane parafie w Strudze i Lubominie.
Kolejny rozdział w historii kościoła w Bogaczowicach wyznacza panowanie opata Bernharda Rosy (1660-1696).
Sprawozdanie z wizytacji w 1667 roku mówi o istnieniu w Starych Bogaczowicach dwóch kościołów: parafialnego (o sklepionym prezbiterium, z wieżą w górnej części drewnianą z zegarem) i św, Mikołaja, który to według oceny wizytatora winien być kościołem parafialnym . Doskonale rozwijająca się gospodarka ziemska i leśna w Starych Bogaczowicach stanowiła znaczące zaplecze gospodarcze dla klasztoru krzeszowskiego.
Jako swoisty pomnik panowania opata Rosy, który należał do nielicznych zleceniodawców, mających w pełni sprecyzowaną świadomość artystyczną, został wybudowany w latach 1685-1689 nowy kościół parafialny. Projekty budowli wykonał w 1684 roku klasztorny mistrz budowlany Martin Urban.
Działalność mistrza murarskiego Marcina Urbana stanowi dobry przykład typu architektury barokowej o wyraźnym piętnie regionalnym. Pochodził on przypuszczalnie z dóbr krzeszowskich. W roku 1683 osiadł na stałe w Lubawce, mieście należącym do klasztoru krzeszowskiego i w tymże roku został mistrzem murarskim. Budowla bogaczowicka była pierwszym samodzielnym dziełem mistrza. Przyniosła mu ona pełne uznanie opata Rosy, jak i dalsze poważne zlecenia.
Rozplanowanie bogaczowickiego kościoła nawiązuje do tradycyjnego, jednonawowe-go schematu z dostawioną na osi wieżą i trójbocznym zamknięciem prezbiterium. Zakrystia umieszczona została poza ołtarzem w zamknięciu prezbiterium. Wciągnięte do wnętrza przypory tworzą płytkie wnęki przesklepione kolebką. Nad szeroko rozpiętymi łukami arkad umieszczono połączone przejściami w grubości przypór empory. Kościół sklepiony kolebką z lunetami. Organizacja wnętrza reprezentuje typ emporowo-halowy. Główne wejście do kościoła (spośród trzech) znajduje się w północnej elewacji.
Wcześniejsze fazy budowlane zdradza oszkarpowana wieża o zwartej kubicznej sylwecie w fasadzie zachodniej zwieńczona dwukondygnacjowym hełmem krytym blachą.
Kolejny opat Krzeszowa, kontynuator Rosy — Dominik Geyer w 1703 roku polecił wznieść dominialne zabudowania klasztorne — prepozyturę. Prace wykonali rzemieślnicy z Krzeszowa. W zabudowaniach tych mieściło się w czasach pruskich państwowe nadleśnictwo. Zabudowania założone są na rzucie podkowy. W budynku północnym znajduje się sień przejazdowa, przez którą prowadzi droga wiodąca na dziedziniec.
Opat Geyer wykorzystał obecność mistrzów budowlanych w Starych Bogaczowicach, by przeprowadzić przebudowę kościoła Św. Mikołaja. Pierwsze uroczyste nabożeństwo odprawione przez ojca Johanna Schwertzela odbyło się w przebudowanym kościele w dniu św. Mikołaja 6 grudnia 1704 roku. Kościół został przebudowany z poprzedniego jako budowla jednonawowa z trójbocznie zamkniętym prezbiterium i oknami zamkniętymi półkolem.. Wyposażenie fundowane było również przez cystersów — w 1725 ambona i nowe dzwony, w 1704 roku przeniesiony został ołtarz ze zburzonej krzeszowskiej kaplicy św. Anny, stamtąd pochodziła również rzeźba św. Mikołaja.
Znaczenie kościoła św. Mikołaja musiało być w XVIII wieku istotne, skoro wyjątkowo został zaznaczony na ówczesnych mapach księstw śląskich umieszczonych w Atlasie Homanna wydanym w 1750 roku.
W 1708 roku proboszczem w Starych Bogaczowicach został Innocenty Fritsch (od 1727 roku opat krzeszowski). On też miał rozpocząć budowę pałacu na południe od zabudowań prepozytury (budowla mogła zamykać układ od południa, w miejscu późniejszego tartaku). Budowla pozostała nieukończona, po 1800 została rozebrana a materiał budowlany został sprzedany. Cysterskie dominium zostało powiększone o browar i słodownię.
W Starych Bogaczowicach prowadzone było przez klasztor wydobycie rud srebra i saletry. Już od czasów klasztornych wykorzystywane były w celach leczniczych źródła wód mineralnych — szczawów. W 30. latach XX w. wieś przyjmowała ok. 500 kuracjuszy
rocznie.
Dobra sytuacja gospodarcza zakonu sprzyjała kolejnym cysterskim fundacjom. Budowę kaplicy w miejscu istniejącego na wzgórzu wcześniej krzyża zainicjował proboszcz bogaczowicki cysters Abundus Heinzel wraz z kapelanem Alexiusem Wiesnerem. Siódmego sierpnia 1735 roku nastąpiło wmurowanie kamienia węgielnego przez opata Benedykta Se-idela, natomiast poświęcenie kaplicy miało miejsce 25.07.1736 roku. Wzgórze zwano odtąd Wzgórzem Św. Anny (Annaberg), a budowla pełniła funkcję kaplicy brackiej miejscowego Bractwa św. Anny.
Do kaplicy usytuowanej na wzgórzu prowadzi aleja lipowa. Przed kaplicą znajduje się rzeźba Matki Boskiej z Dzieciątkiem i obelisk. Budowla założona jest na rzucie kwadratu o ściętych narożach wewnętrznych z dostawionymi na osi apsydami mieszczącymi kruchtę i ołtarz. Budowę kaplicy dla cystersów prowadził Józef Antoni Jentsch (f 1757).
W 1742 roku, w dwa lata po aneksji Śląska przez Prusy i zrównaniu w prawach wyznań ewangelickich z katolickim w Starych Bogaczowicach został wystawiony dom modlitwy dla ewangelików zamieszkujących Stare i Nowe Bogaczowice. W Wielki Czwartek 1742 roku zostało udzielone zezwolenie na budowę zboru (w latach 1741-1746 koncesji na stawianie domów modlitwy udzielał król, bowiem należały one do zakresu regaliów). Nie znana jest dokładna data konsekracji. Pierwszym pastorem został wybrany przez gminę obejmującą Stare Bogaczowice i Chwaliszów Johann Christoph Andritzky. Była to budowla drewniana o prostej architekturze. Uwieczniona została na rycinie Wernera z 1748 roku9,
Zbór murowany został wzniesiony w łatach 1777-1780. Wzniesienie kościoła niektórzy badacze wiążą z osobą architekta wałbrzyskiego, ucznia Langhansa — Leopolda Niederackera, który był wykonawcą przy budowie wałbrzyskiego kościoła ewangelickiego (1785), kościołów w Dzierżoniowie (1789) i w Głuszycy. Kościół założony był na planie prostokąta, jednonawowy z wieżą na dłuższej osi z wnętrzem podzielonym balkonami na słupach, kryty dachem ceramicznym, mansardowym. Kamienny portal o przerwanym naczółku, sygnaturka z hełmem i większość detali architektonicznych nosiły znamiona jeszcze stylistyki barokowej; obramienia okien, tympanon nad elewacją zachodnią — klasycystyczne. W 1967 roku, zaadaptowany na pomieszczenie gospodarczo magazynowe a w roku 2005 ze względu na zły stan techniczny został rozebrany.
W Starych Bogaczowicach dla obu wyznań istniały obok siebie cmentarze położone przy katolickim kościele parafialnym, na południowym obrzeżu miejscowości, na częściowo uprawianym wzniesieniu, opadającym ku północy, do rzeki Strzegomki i zabudowaniom wsi. Cmentarz katolicki założony wraz z kościołem św. Józefa Oblubieńca w końcu XVII wieku, oparty jest na rzucie zaokrąglonym, zbliżonym do trapezu: otoczony kamiennym murem. Cmentarz ewangelicki przylegał do katolickiego po południowej stronie kościoła. Obecnie oba cmentarze zostały połączone w jeden parafialny.
Reprezentacyjne podejście do kościoła katolickiego i na cmentarz prowadzi północnym stokiem wzniesienia, prostym traktem schodów do głównej bramy cmentarnej osadzonej w murze otaczającym od północy nekropolię. Trakt ten prowadzi do północnego wejścia.
Oba cmentarze otoczone zostały wspólnym, kamiennym murem, częściowo przy wykorzystaniu kamieniarki cmentarnej, w ewangelickiej części cmentarza niższym, z granitowych bloków. Brama główna wzniesiona została w XVIII wieku, murowana i tynkowana, na planie prostokąta z przejściem pieszym sklepionym, otwór bramny o półokrągłym wykroju arkady; brama zwieńczona trójkątnym szczytem, kryjącym dach ceramiczny. Prawdopodobnie cmentarz ewangelicki został rozszerzony w pierwszej połowie XIX wieku na południe i otoczony nowym murem z bramą południową. Nowa brama zachodnia powstała w 1828 roku. Wówczas założono regularną kompozycję cmentarza z układem alei i ścieżek. W ich rozplanowaniu czytelny pozostaje dawny układ cmentarza z podziałem na kwatery obu wyznań. Obecnie dawny układ ścieżek został, szczególnie w części grzebalnej, częściowo zatarty. W zachodniej części cmentarza, przy ogrodzeniu usytuowane są szczególnie okazałe grobowce, nagrobki przyścienne oraz budowla grobowa. Schemat założenia przestrzennego cmentarza podkreślony jest przez regularnie zakomponowany drzewostan, niegdyś znacznie bogatszy,
Po sekularyzacji klasztoru krzeszowskiego na cmentarzu chowano również proboszczów parafii bogaczowickiej. Pierwszym pochowanym tu miejscowym proboszczem był zmarły w 1813 roku cysters Florian Weiss. Cmentarz w przeszłości przyjmował również pochówki zmarłych mieszkańców z Chwaliszowa.
Przed aneksją Śląska w 1742 roku nastąpił najkorzystniejszy okres w handlu płótnem, którego produkcją zajmowały się gospodarstwa w Starych Bogaczowicach i okolicznych miejscowościach.
1810 po kasacie klasztoru w Krzeszowie wieś znalazła się pod zarządem państwowym. Wówczas własność cysterska obejmowała 2777 ha w Starych Bogaczowicach, 1180 ha w Chwaliszowie i 530 ha w Nowych Bogaczowicach.
W kościele św. Mikołaja nabożeństwa odbywały się do 1833 roku, wówczas wyposażenie kościoła zostało przeniesione do Wilkowa koło Głogowa, w 1865 roku wieża była już zniszczona, kościół stopniowo był rozbierany na materiał budowlany. Do dzisiaj zachowały się tylko kamienne mury obwodowe (bez ściany zachodniej). W dominialnych zabudowaniach klasztornych, w skrzydle wschodnim mieściła się plebania i szkoła katolicka. W położonym niedaleko budynku szkolnym przekazanym siostrom Szarytkom zorganizowane zostało przedszkole i szwalnia.
Obecna wieś gminna należała do okręgu bolkowsko-kamiennogórskiego dawnego księstwa świdnickiego, od 1818 r. — przyporządkowana do powiatu bolkowskiego rejencji legnickiej, w 1934 roku Stare Bogaczowice włączone zostały do powiatu wałbrzyskiego.